- решает важнейшие проблемы развития АГУ, его учебной, научной, международной, финансовой и хозяйственной деятельности;
- утверждает Устав АГУ, вносит дополнения и изменения к нему;
- утверждает гимн и символику (реквизиты) АГУ;
- рассматривает вопросы изменения структуры АГУ, в том числе создания, реорганизации или ликвидации факультетов и других подразделений АГУ;
- утверждает положения о структурных подразделениях АГУ и иные положения о деятельности университета;
- проводит избрание по конкурсу на должности заведующих кафедрами, преподавателей общеуниверситетских кафедр;
- утверждает кандидатуры деканов факультетов по итогам выборов на расширенных Ученых советах факультетов;
- формирует и утверждает состав Библиотечного совета;
- принимает решение о присвоении ученого звания доцента и профессора;
- принимает правила и план приема абитуриентов в АГУ;
- утверждает тематический план научно-исследовательских работ, ежегодный план проведения научных мероприятий;
- заслушивает ежегодные отчеты проректоров по учебной, научной, воспитательной и хозяйственной работе;
- ежегодно заслушивает и утверждает отчет о финансовой деятельности АГУ;
- присваивает звание Почетного доктора и Почетного профессора Абхазского государственного университета;
- выдвигает кандидатов на присуждение государственных премий РА, вносит в установленном порядке предложения о награждении преподавателей и  сотрудников отраслевыми и государственными наградами и присвоении почетных званий РА;
- принимает решения о предоставлении преподавателям и сотрудникам творческих отпусков и (или) о направлении их на стажировку;
- утверждает кандидатуры студентов на назначение именных стипендий;
- принимает решение о создании или об участии в коммерческих и некоммерческих организациях;
- принимает другие решения, направленные на повышение качества подготовки специалистов и уровня научных исследований.

а) по должности – ректор (председатель), проректоры, главный ученый секретарь, деканы факультетов (филиалов, институтов), директор научной библиотеки, директор Республиканского Центра повышения квалификации и переподготовки специалистов, начальник учебной части АГУ.
б) по выборам – профессорско-преподавательский состав по представлению Ученого совета факультета (тайным голосованием) из расчета один представитель от пятнадцати человек.
Состав Ученого Совета АГУ утверждается приказом Ректора. Срок полномочий Ученого Совета АГУ - пять лет.

считаются принятыми, если в заседании принимало участие не менее 2/3 списочного состава членов Ученого Совета АГУ и за решение проголосовало большинство из присутствующих на заседании (50 %+ 1 голос).
Решения Ученого Совета АГУ обязательны для всех структурных подразделений и членов коллектива университета.
Заседания Ученого Совета АГУ проводятся не реже одного раза в два месяца в течение учебного года.